Shotgun metagenomic analysis of the oral microbiome in gingivitis: A nested case-control study
Publiceringsår
2024
Upphovspersoner
Manzoor, Muhammed ; Leskelä, Jaakko; Pietiäinen, Milla; Martinez-Majander, Nicolas; Könönen, Eija; Niiranen, Teemu; Lahti, Leo; Sinisalo, Juha; Putaala, Jukka; Pussinen, Pirkko J.; Paju, Susanna
Abstrakt
<p>BACKGROUND: Gingivitis, i.e. inflammation of the gums, is often induced by dentalplaque. However, its exact link to the oral microbiota remains unclear.</p><p>METHODS: In a case-control study involving 120 participants, comprising 60 cases and 60 controls (mean age (SD) 36.6 (7.6) years; 50% males), nested within a prospective multicentre cohort study, we examined theoral microbiome composition of gingivitis patients and their controlsusing shotgun metagenomic sequencing of saliva samples. Participants underwent clinical and radiographic oral health examinations, including bleeding on probing (BOP), at six tooth sites. BOP ≥33%was considered 'generalized gingivitis/initial periodontitis'(GG/IP), and BOP <33% as 'healthy and localized gingivitis'(H/LG). Functional potential was inferred using HUMANn3.</p><p>RESULTS: GG/IP exhibited an increase in the abundance of Actinomyces, Porphyromonas, Aggregatibacter, Corynebacterium, Olsenella, and Treponema, whereas H/LG exhibited an increased abundance of Candidatus Nanosynbacter. Nineteen bacterial species and fourmicrobial functional profiles, including L-methionine, glycogen, andinosine-5'-phosphate biosynthesis, were associated with GG/IP. Constructing models with multiple markers resulted in a strong predictive value for GG/IP, with an area under the curve (ROC) of 0.907 (95% CI: 0.848-0.966). </p><p>CONCLUSION: We observed distinct differences in the oral microbiome between the GG/IP and H/LG groups, indicating similar yet unique microbial profiles and emphasizing their potential role in progression of periodontal diseases.</p>
Visa merOrganisationer och upphovspersoner
Teknologiska forskningscentralen VTT Ab
Pietiäinen Milla
Helsingfors universitet
Leskelä Jaakko
Sinisalo Juha
Putaala Jukka
Pietiäinen Milla
Manzoor Muhammed
Martinez-Majander Nicolas
Pussinen Pirkko J.
Paju Susanna
Östra Finlands universitet
Pussinen Pirkko Johanna
Helsingforsregionens universitetscentralsjukhus specialupptagningsområde
Leskelä Jaakko
Sinisalo Juha
Putaala Jukka
Pietiäinen Milla
Manzoor Muhammed
Martinez-Majander Nicolas
Pussinen Pirkko J.
Paju Susanna
Åbo universitetscentralsjukhus specialupptagningsområde
Niiranen Teemu
Publikationstyp
Publikationsform
Artikel
Moderpublikationens typ
Tidning
Artikelstyp
En originalartikel
Målgrupp
VetenskapligKollegialt utvärderad
Kollegialt utvärderadUKM:s publikationstyp
A1 Originalartikel i en vetenskaplig tidskriftPublikationskanalens uppgifter
Journal
Moderpublikationens namn
Volym
16
Nummer
1
ISSN
Publikationsforum
Publikationsforumsnivå
2
Öppen tillgång
Öppen tillgänglighet i förläggarens tjänst
Ja
Öppen tillgång till publikationskanalen
Helt öppen publikationskanal
Parallellsparad
Ja
Övriga uppgifter
Vetenskapsområden
Odontologi; Växtbiologi, mikrobiologi, virologi; Allmänmedicin, inre medicin och annan klinisk medicin
Nyckelord
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Förlagets internationalitet
Internationell
Språk
engelska
Internationell sampublikation
Nej
Sampublikation med ett företag
Nej
DOI
10.1080/20002297.2024.2330867
Publikationen ingår i undervisnings- och kulturministeriets datainsamling
Ja