undefined

Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome

Publiceringsår

2022

Upphovspersoner

Lehtivuori, Heli; Rumfeldt, Jessica; Mustalahti, Satu; Kurkinen, Sami; Takala, Heikki

Abstrakt

Phytochromes are red light-sensing photoreceptor proteins that bind a bilin chromophore. Here, we investigate the role of a conserved histidine (H260) and tyrosine (Y263) in the chromophore-binding domain (CBD) of Deinococcus radiodurans phytochrome (DrBphP). Using crystallography, we show that in the H260A variant, the missing imidazole side chain leads to increased water content in the binding pocket. On the other hand, Y263F mutation reduces the water occupancy around the chromophore. Together, these changes in water coordination alter the protonation and spectroscopic properties of the biliverdin. These results pinpoint the importance of this conserved histidine and tyrosine, and the related water network, for the function and applications of phytochromes.
Visa mer

Organisationer och upphovspersoner

Tammerfors universitet

Lehtivuori Heli Orcid -palvelun logo

Jyväskylä universitet

Takala Heikki Orcid -palvelun logo

Lehtivuori Heli Orcid -palvelun logo

Rumfeldt Jessica Orcid -palvelun logo

Kurkinen Sami

Mustalahti Satu

Åbo universitet

Kurkinen Sami

Publikationstyp

Publikationsform

Artikel

Moderpublikationens typ

Tidning

Artikelstyp

En originalartikel

Målgrupp

Vetenskaplig

Kollegialt utvärderad

Kollegialt utvärderad

UKM:s publikationstyp

A1 Originalartikel i en vetenskaplig tidskrift

Publikationskanalens uppgifter

Volym

21

Nummer

11

Sidor

1975-1989

Publikationsforum

64984

Publikationsforumsnivå

1

Öppen tillgång

Öppen tillgänglighet i förläggarens tjänst

Ja

Öppen tillgång till publikationskanalen

Delvis öppen publikationskanal

Parallellsparad

Ja

Övriga uppgifter

Vetenskapsområden

Nanoteknologi; Biokemi, cell- och molekylärbiologi; Biomedicinska vetenskaper

Nyckelord

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Publiceringsland

Förenade kungariket

Förlagets internationalitet

Internationell

Språk

engelska

Internationell sampublikation

Nej

Sampublikation med ett företag

Nej

DOI

10.1007/s43630-022-00272-6

Publikationen ingår i undervisnings- och kulturministeriets datainsamling

Ja