Vi utvecklar bioinformatiska verktyg och maskininlärning för virusidentifiering och karakterisering. Traditionella metoder identifierar inte alltid nya eller sällsynta virus i frånvaro av sekvensinformation. Vi använder oss av metoder vi utvecklat tidigare, som kan läsa och analysera nukleinsyrorna i proverna utan föregående antaganden och identifiera virala genom, inklusive okända virus. Vi utvecklar metagenomiska analysmetoder och ett intuitivt användargränssnitt för att effektivt kunna studera kliniska och miljömässiga prover. Vidare utvecklar vi förutsägelser av förändringar i struktur och funktion hos virus från gensekvensdata. Målet är en snabb, pålitlig analysmetod för att identifiera nya och atypiska viruspatogener, vilket också kommer att främja kontrollåtgärder.

2024