Genome-wide association studies identify 137 genetic loci for DNA methylation biomarkers of aging

Beskrivning

Abstract Background Biological aging estimators derived from DNA methylation data are heritable and correlate with morbidity and mortality. Consequently, identification of genetic and environmental contributors to the variation in these measures in populations has become a major goal in the field. Results Leveraging DNA methylation and SNP data from more than 40,000 individuals, we identify 137 genome-wide significant loci, of which 113 are novel, from genome-wide association study (GWAS) meta-analyses of four epigenetic clocks and epigenetic surrogate markers for granulocyte proportions and plasminogen activator inhibitor 1 levels, respectively. We find evidence for shared genetic loci associated with the Horvath clock and expression of transcripts encoding genes linked to lipid metabolism and immune function. Notably, these loci are independent of those reported to regulate DNA methylation levels at constituent clock CpGs. A polygenic score for GrimAge acceleration showed strong associations with adiposity-related traits, educational attainment, parental longevity, and C-reactive protein levels. Conclusion This study illuminates the genetic architecture underlying epigenetic aging and its shared genetic contributions with lifestyle factors and longevity.
Visa mer

Publiceringsår

2021

Typ av data

Upphovspersoner

Mika Kähönen - Upphovsperson

Pashupati Mishra - Upphovsperson

Terho Lehtimäki - Upphovsperson

Unknown organization

Adolfo Correa - Upphovsperson

Ake T. Lu - Upphovsperson

Alex P. Reiner - Upphovsperson

Alexandra M. Binder - Upphovsperson

Alicia K. Smith - Upphovsperson

Amit Patki - Upphovsperson

Andre G. Uitterlinden - Upphovsperson

Andrew M. McIntosh - Upphovsperson

Ann Zenobia Moore - Upphovsperson

Annette Peters - Upphovsperson

Ayoung Jeong - Upphovsperson

Beate Ritz - Upphovsperson

Caroline Hayward - Upphovsperson

Caroline L. Relton - Upphovsperson

Christian Gieger - Upphovsperson

Dale P. Sandler - Upphovsperson

Dan Mason - Upphovsperson

Daniel L. McCartney - Upphovsperson

David J. Porteous - Upphovsperson

David J. Van Den Berg - Upphovsperson

Deborah A. Lawlor - Upphovsperson

Dianjianyi Sun - Upphovsperson

Donna Arnett - Upphovsperson

Dorret I. Boomsma - Upphovsperson

Eco J. C. de Geus - Upphovsperson

Elina Sillanpää - Upphovsperson

Eric Boerwinkle - Upphovsperson

Falk W. Lohoff - Upphovsperson

Gail Davies - Upphovsperson

Gibran Hemani - Upphovsperson

Hannah R. Elliott - Upphovsperson

Hemant Tiwari - Upphovsperson

Ian J. Deary - Upphovsperson

Idil Yet - Upphovsperson

Jaakko Kaprio - Upphovsperson

Jack A. Taylor - Upphovsperson

Jacob K. Kresovich - Upphovsperson

James G. Wilson - Upphovsperson

James S. Pankow - Upphovsperson

Jeesun Jung - Upphovsperson

Jennifer A. Smith - Upphovsperson

Jenny van Dongen - Upphovsperson

Jerome I. Rotter - Upphovsperson

Jie Yao - Upphovsperson

Joanne M. Murabito - Upphovsperson

John Wright - Upphovsperson

Jonas Mengel-From - Upphovsperson

Jordana T. Bell - Upphovsperson

Josine L. Min - Upphovsperson

Joyce B. J. van Meurs - Upphovsperson

Kaare Christensen - Upphovsperson

Karen N. Conneely - Upphovsperson

Kathryn L. Lunetta - Upphovsperson

Konstantin Strauch - Upphovsperson

Laura M. Raffield - Upphovsperson

Lili Milani - Upphovsperson

Linda Broer - Upphovsperson

Luigi Ferrucci - Upphovsperson

Marguerite Irvin - Upphovsperson

Maria K. Sobczyk - Upphovsperson

Marianne Nygaard - Upphovsperson

Massimo Mangino - Upphovsperson

Matthijs D. van der Zee - Upphovsperson

Medea Imboden - Upphovsperson

Melanie Waldenberger - Upphovsperson

Melissa C. Southey - Upphovsperson

Mette Soerensen - Upphovsperson

Miina Ollikainen - Upphovsperson

Myriam Fornage - Upphovsperson

Nancy L. Pedersen - Upphovsperson

Nicole Probst-Hensch - Upphovsperson

Oliver Robinson - Upphovsperson

Olli Raitakari - Upphovsperson

Pamela R. Matias-Garcia - Upphovsperson

Paolo Vineis - Upphovsperson

Paul Elliott - Upphovsperson

Pei-Chien Tsai - Upphovsperson

Pei-Lun Kuo - Upphovsperson

Peter Durda - Upphovsperson

Pierre-Antoine Dugué - Upphovsperson

Rebecca C. Richmond - Upphovsperson

Riccardo E. Marioni - Upphovsperson

Roger L. Milne - Upphovsperson

Rosie M. Walker - Upphovsperson

Rui Xia - Upphovsperson

Sara Hägg - Upphovsperson

Sarah E. Harris - Upphovsperson

Scott M. Ratliff - Upphovsperson

Seyma Katrinli - Upphovsperson

Sharon L. R. Kardia - Upphovsperson

Shengxu Li - Upphovsperson

Silva Kasela - Upphovsperson

Silvia Polidoro - Upphovsperson

Stefania Bandinelli - Upphovsperson

Stephen S. Rich - Upphovsperson

Steve Horvath - Upphovsperson

Teemu Palviainen - Upphovsperson

Therese Tillin - Upphovsperson

Tom G. Richardson - Upphovsperson

Toshiko Tanaka - Upphovsperson

Wei Chen - Upphovsperson

Wei Zhao - Upphovsperson

Xiaochuan Wang - Upphovsperson

Xiuqing Guo - Upphovsperson

Yunzhang Wang - Upphovsperson

Zongli Xu - Upphovsperson

figshare - Utgivare

Projekt

Övriga uppgifter

Vetenskapsområden

Biomedicinska vetenskaper

Språk

engelska

Öppen tillgång

Öppet

Licens

Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)

Nyckelord

Biomedicine

Ämnesord

Temporal täckning

undefined

Relaterade till denna forskningsdata